A Szcientológia Egyházat hivatalosan elismerik vallásként Spanyolországban. 2007. október 31‑én a madridi Nemzeti Bíróság egyhangú történelmi döntéssel megerősítette a vallásszabadság jogát Spanyolországban, azáltal hogy elismerte, hogy a Spanyolországi Nemzeti Szcientológia Egyház vallásos szervezet, amely jogosult az összes abból fakadó vallásos jogra, hogy bejegyezték a Vallási szervezetek jegyzékébe.
Ez az elismerés véget vetett egy olyan korszaknak, amelyben a spanyol szcientológusok arra kényszerültek, hogy harcoljanak az őket megillető vallásszabadság jogáért. Igazolta a Spanyolországi Szcientológia Egyházat, és egy új kezdet volt minden spanyol szcientológus számára.
Ma nincs semmi kétség a Szcientológia legitimitását illetőleg a világvallások egyikeként. Teológiáját, vallási gyakorlatát és szervezetét tekintve, a Szcientológia a vallás szó meghatározása szerint teljesen kifejlett. A vallás több ezer Szcientológia-egyházat, missziót és kapcsolódó szervezetet fog össze a világ 167 országában, amelyek közös vallásos céllal rendelkeznek, és hívek millióit szolgálják.
A Nemzeti Bíróság tüzetesen megvizsgálta a Szcientológia Egyház alapító dokumentumait, céljait és szándékait, és egyértelműen megállapította, hogy a Spanyolországi Nemzeti Szcientológia Egyház jogában áll, hogy vallásként bejegyezzék a spanyol jognak megfelelően. Konkrétan, a Nemzeti Bíróság megállapította, hogy a Szcientológia Egyház joga arra, hogy bejegyezzék vallási szervezetként, egy megjelenési formája a vallásszabadságra és a Szcientológia vallás kollektív gyakorlására való jogának.
Miközben erre a megállapításra jutott, a bíróság megerősítette a következő alapelvet: „Egy vallási szervezet lajstromba vétele magában hordozza mindenekfelett vallási csoportként való jogi státusának elismerését, azaz olyan emberek egy csoportjának azonosítását és törvényes elismerését, akik – a kényszertől való immunitást élvezve – élni kívánnak a vallásszabadság kollektív gyakorlására vonatkozó alapvető jogukkal, ahogy azt a spanyol Vallásszabadsági törvény 5.2 cikke biztosítja.”
„Ez a minisztérium megállapította, hogy engedélyezi a regisztrációt az IGLESIA DI SCIENTOLOGY DE ESPAÑA elnevezésű vallási jogi személy számára… a Vallásszabadsági Alaptörvény (7/1980) 5. cikke által megalkotott jogszabály értelmében, hogy garantálja tevékenységei gyakorlását a fennálló szabályozással összhangban.”
